80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0052 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1384  hypothetical protein  98.78 
 
 
329 aa  659    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0052  L-asparaginase II  100 
 
 
329 aa  663    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.527495  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0043  L-asparaginase II  85.37 
 
 
329 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2503  L-asparaginase II  68.5 
 
 
328 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.954342  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3016  L-asparaginase II  60.96 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.41444 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0266  L-asparaginase II  57.32 
 
 
335 aa  335  5e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0784  L-asparaginase II  43.47 
 
 
335 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.109561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0570  L-asparaginase II  43.2 
 
 
336 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878025  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0899  L-asparaginase II  42.86 
 
 
335 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.499511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3723  L-asparaginase II  37.42 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962926 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1163  hypothetical protein  42.25 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0471275  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0555  hypothetical protein  41.54 
 
 
340 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.943367  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0556  hypothetical protein  41.54 
 
 
340 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0851  L-asparaginase II  41.87 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0311  L-asparaginase II  35.71 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1961  L-asparaginase II  42.68 
 
 
338 aa  182  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.91013 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2866  L-asparaginase II  37.69 
 
 
332 aa  180  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.687788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2069  L-asparaginase II  38.64 
 
 
331 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1154  L-asparaginase II  38.23 
 
 
340 aa  170  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0198  hypothetical protein  32.32 
 
 
329 aa  169  5e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3020  asparaginase  36.84 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01750  asparaginase  32.83 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3025  putative L-asparaginase II  38.1 
 
 
362 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3023  L-asparaginase II  41.21 
 
 
349 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03610  L-asparaginase II  37.54 
 
 
336 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.476586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5040  L-asparaginase II  39.27 
 
 
324 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4062  L-asparaginase II  36.39 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.351412  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0110  L-asparaginase II  39.73 
 
 
324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.0405603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4304  L-asparaginase II  36.39 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.086878  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4204  L-asparaginase II  37.92 
 
 
324 aa  155  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4212  L-asparaginase II  35.88 
 
 
349 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5753  L-asparaginase II  35.14 
 
 
367 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736318  normal  0.170575 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3460  L-asparaginase II  36.39 
 
 
353 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1423  L-asparaginase II  37.15 
 
 
363 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0315  L-asparaginase II  37.76 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3408  L-asparaginase II  37.28 
 
 
338 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3189  L-asparaginase II  37.87 
 
 
338 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0338  L-asparaginase II  36.92 
 
 
335 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1300  L-asparaginase II  37.61 
 
 
342 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.462652  normal  0.291361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1986  L-asparaginase II  35.51 
 
 
354 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0435  L-asparaginase II  39.3 
 
 
320 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6297  hypothetical protein  40 
 
 
326 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195036  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37770  L-asparaginase II  37.61 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1075  L-asparaginase II  41.95 
 
 
331 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18570  L-asparaginase II  37.3 
 
 
357 aa  145  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1567  L-asparaginase II  37.2 
 
 
316 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0482  L-asparaginase II  38.38 
 
 
312 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00939216  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1336  L-asparaginase II  34.14 
 
 
336 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.156479  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3962  L-asparaginase II  35.67 
 
 
354 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.596306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0378  L-asparaginase II  37.97 
 
 
326 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0173551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3455  L-asparaginase II  35.67 
 
 
354 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4623  L-asparaginase II  37.84 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09195  thermolabile L-asparaginase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11890)  33.76 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.689937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8238  L-asparaginase II  38.51 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.721473  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0659  L-asparaginase II  36 
 
 
328 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3757  L-asparaginase II  38.54 
 
 
348 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4556  L-asparaginase II  34.11 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6126  L-asparaginase II  37.89 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3410  L-asparaginase II  37.2 
 
 
324 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0840  hypothetical protein  36.08 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3083  L-asparaginase II  37.58 
 
 
327 aa  129  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0922  L-asparaginase II  36.3 
 
 
313 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3975  L-asparaginase II  38.19 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4641  asparaginase  31.76 
 
 
316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599926  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1815  hypothetical protein  34.23 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.735411  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0166  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13811  L-asparaginase II  34.23 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10491  L-asparaginase II  26.87 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1785  L-asparaginase II  31.91 
 
 
317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2513  L-asparaginase II  30.87 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.852164  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09461  L-asparaginase II  28.53 
 
 
320 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0821192  hitchhiker  0.0000193359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0733  L-asparaginase II  29.85 
 
 
317 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000465625  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6476  L-asparaginase II  34.11 
 
 
396 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0461805 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3000  L-asparaginase II  29.97 
 
 
317 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169093  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3120  L-asparaginase II  29.97 
 
 
317 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08961  L-asparaginase II  27.7 
 
 
304 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10491  L-asparaginase II  26.69 
 
 
321 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0979  L-asparaginase II  26.67 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.225004  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08881  L-asparaginase II  26.81 
 
 
320 aa  96.3  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.415864  hitchhiker  0.0000135273 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0222  L-asparaginase II  27.54 
 
 
320 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0254392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>