116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7474 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7474  dehydratase  100 
 
 
144 aa  291  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1546  dehydratase  77.46 
 
 
146 aa  227  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154043  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0499  hypothetical protein  68.8 
 
 
128 aa  185  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718353  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0214  hypothetical protein  61 
 
 
111 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.815005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0437  MaoC domain protein dehydratase  40.3 
 
 
163 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4273  hypothetical protein  38.81 
 
 
159 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0955095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0162  dehydratase  37.86 
 
 
151 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1393  hypothetical protein  61.45 
 
 
93 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2547  MaoC domain-containing protein  57.84 
 
 
113 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1590  hypothetical protein  62.5 
 
 
90 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0971  MaoC family protein  57.55 
 
 
117 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2693  MaoC domain-containing protein  58.82 
 
 
95 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6220  MaoC domain protein dehydratase  38.4 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7894  MaoC domain protein dehydratase  34.38 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1023  dehydratase  37.88 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4178  dehydratase  29.92 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4238  dehydratase  31.3 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0972  hypothetical protein  59.52 
 
 
49 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2548  hypothetical protein  59.52 
 
 
49 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.7375  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2694  hypothetical protein  54.55 
 
 
49 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1392  hypothetical protein  52.27 
 
 
49 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1589  hypothetical protein  52.27 
 
 
49 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  29.66 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0292  Enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000103389  hitchhiker  0.0000892169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  25.17 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0249  hypothetical protein  60.53 
 
 
48 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  25.2 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  29.17 
 
 
173 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3371  MaoC domain-containing protein  25.98 
 
 
141 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4505  MaoC-like dehydratase  25 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.547822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  28.69 
 
 
150 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4251  MaoC domain protein dehydratase  36.23 
 
 
220 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.29 
 
 
481 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.29 
 
 
481 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1205  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  26.61 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  29.17 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  28.46 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0052  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.97 
 
 
468 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70674  normal  0.03837 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1047  dehydratase  30.71 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0118845  normal  0.124515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  28.47 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  28.28 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1226  maoC family protein  26.61 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1203  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  26.61 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  28.69 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1326  MaoC family protein  26.61 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  29.27 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1466  maoC family protein  26.61 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1364  maoC family protein  26.61 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.168458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3980  maoC family protein  26.61 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1401  maoC family protein  26.61 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  29.31 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  27.78 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  27.78 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2125  MaoC-like dehydratase  40 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.133316  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  27.78 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  28.57 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  25.6 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2459  MaoC domain protein dehydratase  33.63 
 
 
211 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5510  MaoC domain protein dehydratase  22.86 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.427484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  28.7 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  30.19 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46430  hypothetical protein  24.19 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6428  MaoC-like dehydratase  25.19 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.632937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0357  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  28.1 
 
 
467 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465716  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1940  MaoC-like dehydratase  29.41 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6129  dehydratase  25.53 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0121  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.52 
 
 
476 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  26.32 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  22.73 
 
 
464 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1227  dehydratase  25.81 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0047  MaoC domain protein dehydratase  28.44 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1425  maoC family protein  25.81 
 
 
147 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1058  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.52 
 
 
467 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  28.87 
 
 
472 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1289  MaoC-like dehydratase  25.64 
 
 
149 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6530  dehydratase  24.41 
 
 
152 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82464  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1286  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.52 
 
 
467 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2798  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.52 
 
 
467 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2655  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.52 
 
 
467 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0145  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.52 
 
 
467 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.880803  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  23.13 
 
 
156 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6403  dehydratase  28.57 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394709 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6245  dehydratase  24.41 
 
 
152 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1040  MaoC domain protein dehydratase  34.15 
 
 
219 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1355  acyl dehydratase  32.63 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0310  dehydratase  29.63 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.253622  normal  0.0323885 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6218  dehydratase  32.88 
 
 
177 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  29.63 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5106  MaoC domain protein dehydratase  31.37 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1676  MaoC-like dehydratase  30.93 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1672  MaoC-like dehydratase  29.13 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  22.3 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  31.33 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0987  MaoC domain protein dehydratase  34.52 
 
 
205 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.889012 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  25.89 
 
 
344 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  30 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  27.27 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4641  MaoC domain protein dehydratase  31.37 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00972568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1309  MoaC domain-containing protein  30.33 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1318  MoaC domain-containing protein  30.33 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>