18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0274 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0274    100 
 
 		 642 bp  1273    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.844283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  87.03 
 
 		 348 bp  176  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  91.67 
 
 		 369 bp  127  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  91.67 
 
 		 354 bp  127  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  91.67 
 
 		 369 bp  127  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6026    89.62 
 
 		 752 bp  123  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  82.5 
 
 		 369 bp  119  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  82.5 
 
 		 369 bp  119  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1221  transposase, IS4 family protein  86.61 
 
 		 387 bp  117  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37626  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2703  transposase, IS4 family protein  86.61 
 
 		 387 bp  117  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0101  transposase, IS4 family protein  85.83 
 
 		 387 bp  109  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.570733  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7001  transposase IS4 family protein  87.76 
 
 		 387 bp  99.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1108  transposase IS4 family protein  83.58 
 
 		 387 bp  91.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479399  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1124  transposase IS4 family protein  83.58 
 
 		 387 bp  91.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524829  hitchhiker  0.00145263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4244  transposase IS4 family protein  83.58 
 
 		 387 bp  91.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7002    87.88 
 
 		 323 bp  67.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3141  hypothetical protein  81.82 
 
 		 327 bp  48.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4126  hypothetical protein  96.43 
 
 		 294 bp  48.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>