36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1149 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1629  fimbrial protein  100 
 
 
341 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275748  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1549  fimbrial protein  91.2 
 
 
340 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0623048  normal  0.894939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1526  fimbrial protein  92.38 
 
 
340 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877193  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1149  fimbrial protein  100 
 
 
341 aa  696    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0244078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1604  fimbrial protein  97.95 
 
 
341 aa  685    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967498  normal  0.162953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4774  fimbrial protein  73.68 
 
 
341 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0314  hypothetical protein  70.55 
 
 
341 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446275  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0846  fimbrial protein  70.55 
 
 
341 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.462471  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1912  hypothetical protein  70.26 
 
 
352 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1899  hypothetical protein  70.26 
 
 
352 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.382782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1652  fimbrial protein  70.55 
 
 
341 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.848444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2063  hypothetical protein  70.96 
 
 
334 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0644241  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1609  hypothetical protein  67.25 
 
 
343 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343381  hitchhiker  0.00899071 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2441  hypothetical protein  70.32 
 
 
330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1318  hypothetical protein  28.78 
 
 
332 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.78443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3748  hypothetical protein  29.33 
 
 
329 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1135  hypothetical protein  27.08 
 
 
332 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.173666 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4163  hypothetical protein  27.22 
 
 
328 aa  90.9  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4104  hypothetical protein  26.22 
 
 
328 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0054  fimbrial protein  26.92 
 
 
328 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04796  hypothetical protein  26.75 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1522  hypothetical protein  25.94 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0124645  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2939  hypothetical protein  24.1 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0742  hypothetical protein  24.1 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0764  hypothetical protein  24.1 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0806  hypothetical protein  24.09 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.848174  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00665  hypothetical protein  23.96 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00676  predicted fimbrial-like adhesin protein  23.96 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2920  conserved hypothetical protein  24.93 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.935477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0823  hypothetical protein  25.07 
 
 
344 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3224  hypothetical protein  22.89 
 
 
354 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0202071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0652  conserved hypothetical protein  24.21 
 
 
354 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02868  hypothetical protein  24.21 
 
 
354 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02918  hypothetical protein  24.21 
 
 
354 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0651  hypothetical protein  23.63 
 
 
343 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3511  hypothetical protein  23.64 
 
 
354 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.263712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>