17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04796 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04796  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  706    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1609  hypothetical protein  27.39 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343381  hitchhiker  0.00899071 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1149  fimbrial protein  26.84 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1629  fimbrial protein  26.84 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1604  fimbrial protein  26.52 
 
 
341 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967498  normal  0.162953 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1549  fimbrial protein  26.58 
 
 
340 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0623048  normal  0.894939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1526  fimbrial protein  26.58 
 
 
340 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4774  fimbrial protein  26.98 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0314  hypothetical protein  25.84 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446275  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0846  fimbrial protein  25.84 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.462471  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1652  fimbrial protein  25.84 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.848444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1912  hypothetical protein  25.84 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1899  hypothetical protein  25.84 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.382782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2063  hypothetical protein  25.84 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0644241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2441  hypothetical protein  26.26 
 
 
330 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290415  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3748  hypothetical protein  24.36 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1318  hypothetical protein  23.95 
 
 
332 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.78443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>