36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0054 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0054  fimbrial protein  100 
 
 		 328 aa  658    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4163  hypothetical protein  99.7 
 
 		 328 aa  657    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4104  hypothetical protein  98.78 
 
 		 328 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0806  hypothetical protein  30.77 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.848174  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00676  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.61 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00665  hypothetical protein  31.61 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2920  conserved hypothetical protein  31.75 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.935477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2939  hypothetical protein  31.61 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0742  hypothetical protein  31.61 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0764  hypothetical protein  31.61 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4774  fimbrial protein  30.12 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3748  hypothetical protein  27.08 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3511  hypothetical protein  25.57 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.263712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1522  hypothetical protein  27.16 
 
 		 347 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0124645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3224  hypothetical protein  24.86 
 
 		 354 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0202071  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0823  hypothetical protein  28.29 
 
 		 344 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0651  hypothetical protein  25.44 
 
 		 343 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1609  hypothetical protein  28.74 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343381  hitchhiker  0.00899071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1549  fimbrial protein  26.89 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0623048  normal  0.894939 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02918  hypothetical protein  25.28 
 
 		 354 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02868  hypothetical protein  25.28 
 
 		 354 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0652  conserved hypothetical protein  25.28 
 
 		 354 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1318  hypothetical protein  25.46 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.78443  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1526  fimbrial protein  26.59 
 
 		 340 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877193  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1629  fimbrial protein  26.92 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1149  fimbrial protein  26.92 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0244078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1604  fimbrial protein  25.36 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967498  normal  0.162953 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1912  hypothetical protein  27.93 
 
 		 352 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1652  fimbrial protein  27.93 
 
 		 341 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.848444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0314  hypothetical protein  27.93 
 
 		 341 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446275  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0846  fimbrial protein  27.93 
 
 		 341 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.462471  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1899  hypothetical protein  27.93 
 
 		 352 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.382782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2063  hypothetical protein  27.93 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0644241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1135  hypothetical protein  26.03 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.173666 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2441  hypothetical protein  27.36 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290415  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0731  hypothetical protein  30.4 
 
 		 124 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.326157  normal  0.812006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>