29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1135 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1135  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  683    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.173666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1318  hypothetical protein  80.12 
 
 		 332 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.78443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3748  hypothetical protein  36.65 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1609  hypothetical protein  27 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343381  hitchhiker  0.00899071 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1912  hypothetical protein  27.46 
 
 		 352 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141731  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2063  hypothetical protein  27.46 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0644241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0846  fimbrial protein  27.16 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.462471  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1652  fimbrial protein  27.16 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.848444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0314  hypothetical protein  27.16 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446275  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1899  hypothetical protein  27.46 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.382782  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2441  hypothetical protein  26.33 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290415  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4774  fimbrial protein  26.84 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1526  fimbrial protein  27.62 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1549  fimbrial protein  27.62 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0623048  normal  0.894939 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1629  fimbrial protein  27.3 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1149  fimbrial protein  27.3 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0244078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1604  fimbrial protein  28.32 
 
 		 341 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967498  normal  0.162953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1522  hypothetical protein  24.18 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0124645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4104  hypothetical protein  26.67 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4163  hypothetical protein  25.22 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0054  fimbrial protein  25.22 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00665  hypothetical protein  24.44 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00676  predicted fimbrial-like adhesin protein  24.44 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0742  hypothetical protein  24.72 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2939  hypothetical protein  24.72 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0764  hypothetical protein  24.72 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0806  hypothetical protein  25.34 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.848174  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2920  conserved hypothetical protein  24.05 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.935477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0823  hypothetical protein  23.19 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>