23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1047 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1527  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.149151  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1047  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1503  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000219936 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4667  hypothetical protein  82.76 
 
 
110 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613007  decreased coverage  0.000608941 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1409  hypothetical protein  49.33 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1449  hypothetical protein  45 
 
 
109 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145056  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2792  hypothetical protein  48.61 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2536  hypothetical protein  56.14 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1726  hypothetical protein  50.94 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000356622 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1774  hypothetical protein  56.14 
 
 
122 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0042105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1795  hypothetical protein  56.14 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000175143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1949  hypothetical protein  56.14 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000272538  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1772  hypothetical protein  54.39 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0129205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0123  hypothetical protein  54.39 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000625285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1042  hypothetical protein  54.39 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.572721  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1659  hypothetical protein  56.25 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69389  normal  0.537335 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5415  putative lipoprotein  35.59 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0799703  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4254  putative signal peptide protein  46.81 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.319211 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4364  signal peptide protein  46.81 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.386611  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3660  hypothetical protein  34.29 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4451  hypothetical protein  36.67 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02588  signal peptide protein  39.13 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.64703  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2327  hypothetical protein  40.62 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>