22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2792 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2792  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  238  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1659  hypothetical protein  80.22 
 
 
104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69389  normal  0.537335 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1949  hypothetical protein  62.75 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000272538  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1795  hypothetical protein  62.75 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000175143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1774  hypothetical protein  62.75 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0042105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2536  hypothetical protein  60.78 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1042  hypothetical protein  60.78 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.572721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0123  hypothetical protein  60.78 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000625285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1772  hypothetical protein  60.78 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0129205  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1726  hypothetical protein  44.58 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000356622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1409  hypothetical protein  60.38 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1449  hypothetical protein  42.17 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145056  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1527  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.149151  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1047  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1503  hypothetical protein  50 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000219936 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4667  hypothetical protein  54.72 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613007  decreased coverage  0.000608941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5415  putative lipoprotein  43.48 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0799703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2327  hypothetical protein  38.57 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3660  hypothetical protein  38.71 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4254  putative signal peptide protein  41.07 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.319211 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4364  signal peptide protein  41.07 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.386611  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02588  signal peptide protein  35.94 
 
 
109 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.64703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>