16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4364 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4254  putative signal peptide protein  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.319211 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4364  signal peptide protein  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.386611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02588  signal peptide protein  59.09 
 
 		 109 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5415  putative lipoprotein  58.49 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0799703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2327  hypothetical protein  41.54 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1409  hypothetical protein  51.06 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3660  hypothetical protein  48.89 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1726  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000356622 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1047  hypothetical protein  46.81 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1527  hypothetical protein  46.81 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.149151  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1503  hypothetical protein  46.81 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000219936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1659  hypothetical protein  41.67 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69389  normal  0.537335 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4667  hypothetical protein  46.81 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613007  decreased coverage  0.000608941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2792  hypothetical protein  42.86 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1449  hypothetical protein  36.84 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4451  hypothetical protein  45.65 
 
 		 139 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>