15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4451 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4451  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  280  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1663  hypothetical protein  45.1 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00758505  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1409  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1726  hypothetical protein  39.62 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000356622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2327  hypothetical protein  38.33 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2066  hypothetical protein  42.19 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.411385  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3660  hypothetical protein  39.39 
 
 		 122 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5415  putative lipoprotein  39.66 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1636  hypothetical protein  40.48 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1047  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1527  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.149151  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1503  hypothetical protein  41.67 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000219936 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4667  hypothetical protein  39.58 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613007  decreased coverage  0.000608941 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4254  putative signal peptide protein  45.65 
 
 		 109 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.319211 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4364  signal peptide protein  45.65 
 
 		 109 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.386611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>