29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4988 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4988  FHA domain-containing protein  100 
 
 
333 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3131  FHA domain-containing protein  97.3 
 
 
333 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5140  FHA domain-containing protein  91.59 
 
 
333 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5719  FHA domain-containing protein  91.59 
 
 
333 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225135  normal  0.254458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4508  FHA domain-containing protein  91.29 
 
 
333 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.91985  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3161  FHA domain-containing protein  86.14 
 
 
333 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0019  FHA domain-containing protein  59.55 
 
 
335 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0800  FHA domain-containing protein  59.55 
 
 
335 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0513  FHA domain-containing protein  59.87 
 
 
335 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0633  FHA domain-containing protein  59.16 
 
 
332 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.723883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2489  FHA domain-containing protein  59.16 
 
 
332 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.286925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0618  FHA domain-containing protein  59.16 
 
 
332 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.657455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2218  FHA domain-containing protein  59.16 
 
 
332 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2865  FHA domain-containing protein  59.16 
 
 
332 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4369  FHA domain-containing protein  40.97 
 
 
314 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477946  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3060  FHA domain-containing protein  39.06 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1859  forkhead-associated protein  28.04 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3726  forkhead-associated  32.57 
 
 
318 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0998  FHA domain-containing protein  29.69 
 
 
337 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3184  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148023  normal  0.306056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2158  FHA domain containing protein  33.22 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6306  FHA domain containing protein  33.45 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  45 
 
 
470 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1341  FHA domain containing protein  35.63 
 
 
374 aa  50.4  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  38.55 
 
 
174 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1780  FHA domain-containing protein  36.76 
 
 
154 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257566  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2060  FHA domain-containing protein  31.87 
 
 
154 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52887  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  41.79 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  34.94 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>