15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4463 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4463  major facilitator transporter  100 
 
 		 399 aa  779    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4985  major facilitator transporter  94.47 
 
 		 399 aa  695    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00378  putative transport transmembrane protein  85.93 
 
 		 399 aa  631  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0895  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.519067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 432 aa  53.1  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  25 
 
 		 422 aa  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.22 
 
 		 1833 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4964  d-galactonate transporter  23.18 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169087  normal  0.027359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2785  d-galactonate transporter  23.18 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.0710234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1226  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.403066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4811  d-galactonate transporter  23.18 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00271172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>