13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4985 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00378  putative transport transmembrane protein  87.19 
 
 		 399 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4463  major facilitator transporter  94.47 
 
 		 399 aa  718    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4985  major facilitator transporter  100 
 
 		 399 aa  776    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0895  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.519067  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4811  d-galactonate transporter  23.84 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00271172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4964  d-galactonate transporter  23.84 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169087  normal  0.027359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2785  d-galactonate transporter  23.84 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.0710234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  28.33 
 
 		 411 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.4 
 
 		 1833 aa  43.1  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>