39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0154 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0432  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  278  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0154  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  278  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628833  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1194  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  278  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1407  MarC membrane protein  81.45 
 
 		 412 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0010  membrane efflux protein  81.45 
 
 		 412 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1493  putative membrane efflux protein  94.9 
 
 		 412 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191145  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  54.79 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  52.05 
 
 		 440 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  49.32 
 
 		 440 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  49.32 
 
 		 440 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  47.37 
 
 		 440 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  49.32 
 
 		 440 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  47.37 
 
 		 440 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  47.37 
 
 		 440 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 		 436 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  48.33 
 
 		 436 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  44.62 
 
 		 439 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  44.62 
 
 		 434 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  47.62 
 
 		 432 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 		 435 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  46.03 
 
 		 432 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  46.03 
 
 		 432 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  46.03 
 
 		 432 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  46.03 
 
 		 432 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  46.03 
 
 		 434 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  44.44 
 
 		 432 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  42.59 
 
 		 441 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  43.1 
 
 		 448 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0374  phenylacetate-CoA ligase  37.66 
 
 		 441 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000302001  hitchhiker  0.00000497277 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  44.44 
 
 		 432 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  39.68 
 
 		 431 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  41.27 
 
 		 436 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  38.24 
 
 		 441 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3944  phenylacetate-CoA ligase  45.61 
 
 		 439 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  41.27 
 
 		 436 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2870  phenylacetate-CoA ligase  41.38 
 
 		 442 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  34.33 
 
 		 438 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  42.37 
 
 		 434 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  41.27 
 
 		 434 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>