33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1194 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1194  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0432  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0154  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628833  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0010  membrane efflux protein  94 
 
 
412 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1407  MarC membrane protein  94 
 
 
412 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1493  putative membrane efflux protein  93 
 
 
412 aa  184  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191145  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  54.79 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  52.05 
 
 
440 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  49.32 
 
 
440 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  47.37 
 
 
440 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  47.37 
 
 
440 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  49.32 
 
 
440 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  47.37 
 
 
440 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  49.32 
 
 
440 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  47.06 
 
 
436 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  49.15 
 
 
436 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  48.53 
 
 
435 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  44.62 
 
 
439 aa  48.5  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  44.62 
 
 
434 aa  48.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  47.62 
 
 
432 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  42.59 
 
 
441 aa  45.1  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  46.03 
 
 
432 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  46.03 
 
 
432 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  46.03 
 
 
432 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  46.03 
 
 
432 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  43.86 
 
 
448 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  46.03 
 
 
434 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  44.44 
 
 
432 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  39.68 
 
 
431 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0374  phenylacetate-CoA ligase  37.66 
 
 
441 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000302001  hitchhiker  0.00000497277 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  44.44 
 
 
432 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  41.27 
 
 
436 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  38.24 
 
 
441 aa  42  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>