30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0691 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0691  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  432  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1386  hypothetical protein  27.27 
 
 
205 aa  58.9  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.260394  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1762  hypothetical protein  30 
 
 
217 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3675  hypothetical protein  27.32 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408341  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1890  hypothetical protein  27.95 
 
 
192 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0098022  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5177  hypothetical protein  30 
 
 
299 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11069  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1650  hypothetical protein  23.2 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000541072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6782  hypothetical protein  32.5 
 
 
196 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1473  hypothetical protein  27.88 
 
 
190 aa  51.6  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84596  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1551  hypothetical protein  25.77 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1900  hypothetical protein  28.57 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1888  hypothetical protein  27.71 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1891  hypothetical protein  30.51 
 
 
206 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2831  hypothetical protein  30.07 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.674446  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1657  hypothetical protein  28.12 
 
 
202 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1531  hypothetical protein  33.67 
 
 
199 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.369957  normal  0.595416 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2262  hypothetical protein  27.23 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2200  hypothetical protein  28.31 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.13428 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2257  hypothetical protein  28.31 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177931  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2211  hypothetical protein  28.31 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12695  hypothetical protein  29.19 
 
 
261 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000281154  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16400  hypothetical protein  26.92 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1728  hypothetical protein  27.43 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674056  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2480  hypothetical protein  26.79 
 
 
193 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.264009 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24100  hypothetical protein  25 
 
 
188 aa  45.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0403193  normal  0.0325887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3920  hypothetical protein  24.87 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165223  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3545  hypothetical protein  27.15 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000113878  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1584  hypothetical protein  23.93 
 
 
199 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145773  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12950  hypothetical protein  25.15 
 
 
204 aa  41.6  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0681292  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15680  hypothetical protein  30.34 
 
 
193 aa  41.6  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101032  normal  0.804172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>