37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2211 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2211  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2200  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.13428 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2257  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177931  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3920  hypothetical protein  90.16 
 
 
193 aa  357  5e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165223  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2480  hypothetical protein  89.12 
 
 
193 aa  352  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.264009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12695  hypothetical protein  83.94 
 
 
261 aa  339  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000281154  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1891  hypothetical protein  70.97 
 
 
206 aa  271  6e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2262  hypothetical protein  66.5 
 
 
211 aa  255  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24100  hypothetical protein  54.84 
 
 
188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0403193  normal  0.0325887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1551  hypothetical protein  50.54 
 
 
182 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1473  hypothetical protein  50.53 
 
 
190 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84596  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3545  hypothetical protein  52.94 
 
 
199 aa  160  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000113878  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1531  hypothetical protein  48.44 
 
 
199 aa  157  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.369957  normal  0.595416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1888  hypothetical protein  47.54 
 
 
209 aa  153  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1900  hypothetical protein  44.74 
 
 
193 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3675  hypothetical protein  44.1 
 
 
209 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2553  hypothetical protein  43.65 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000429414  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1728  hypothetical protein  42.78 
 
 
208 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674056  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1890  hypothetical protein  42.25 
 
 
192 aa  139  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0098022  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1762  hypothetical protein  46.51 
 
 
217 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6722  hypothetical protein  46.11 
 
 
198 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2265  hypothetical protein  43.89 
 
 
198 aa  134  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349785 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1386  hypothetical protein  43.58 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.260394  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1650  hypothetical protein  39.13 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000541072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1965  hypothetical protein  40.62 
 
 
198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116424  hitchhiker  0.0000364036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2831  hypothetical protein  44.32 
 
 
191 aa  124  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.674446  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1332  hypothetical protein  39.53 
 
 
217 aa  122  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00477709  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16400  hypothetical protein  37.43 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1657  hypothetical protein  37.81 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6782  hypothetical protein  41.33 
 
 
196 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5177  hypothetical protein  37.33 
 
 
299 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11069  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12950  hypothetical protein  37.3 
 
 
204 aa  108  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0681292  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13760  hypothetical protein  42.18 
 
 
227 aa  106  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1584  hypothetical protein  40 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145773  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1391  hypothetical protein  33.87 
 
 
190 aa  94  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.070586  normal  0.270658 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15680  hypothetical protein  38.89 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101032  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0691  hypothetical protein  28.31 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>