37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1891 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1891  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  411  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12695  hypothetical protein  71.81 
 
 
261 aa  279  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000281154  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2480  hypothetical protein  72.04 
 
 
193 aa  271  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.264009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2211  hypothetical protein  70.97 
 
 
193 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2257  hypothetical protein  70.97 
 
 
193 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177931  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2200  hypothetical protein  70.97 
 
 
193 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.13428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3920  hypothetical protein  70.43 
 
 
193 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165223  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2262  hypothetical protein  64.71 
 
 
211 aa  245  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1551  hypothetical protein  51.85 
 
 
182 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24100  hypothetical protein  53.01 
 
 
188 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0403193  normal  0.0325887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1473  hypothetical protein  51.35 
 
 
190 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84596  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1888  hypothetical protein  47.85 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1531  hypothetical protein  51.09 
 
 
199 aa  161  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.369957  normal  0.595416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3545  hypothetical protein  52.15 
 
 
199 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000113878  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1900  hypothetical protein  47.54 
 
 
193 aa  154  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3675  hypothetical protein  44.62 
 
 
209 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2553  hypothetical protein  45.11 
 
 
192 aa  148  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000429414  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1728  hypothetical protein  44.89 
 
 
208 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674056  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1762  hypothetical protein  44.81 
 
 
217 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6722  hypothetical protein  48.5 
 
 
198 aa  141  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2265  hypothetical protein  45.36 
 
 
198 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349785 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1890  hypothetical protein  42.16 
 
 
192 aa  136  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0098022  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16400  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2831  hypothetical protein  44.69 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.674446  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1332  hypothetical protein  38.24 
 
 
217 aa  128  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00477709  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1386  hypothetical protein  40.56 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.260394  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1657  hypothetical protein  38.14 
 
 
202 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21151  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1650  hypothetical protein  36.08 
 
 
216 aa  121  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000541072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5177  hypothetical protein  35.71 
 
 
299 aa  121  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11069  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6782  hypothetical protein  41.36 
 
 
196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1965  hypothetical protein  40.22 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116424  hitchhiker  0.0000364036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1584  hypothetical protein  39.34 
 
 
199 aa  108  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145773  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12950  hypothetical protein  34.85 
 
 
204 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0681292  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15680  hypothetical protein  36.87 
 
 
193 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101032  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13760  hypothetical protein  37.41 
 
 
227 aa  101  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1391  hypothetical protein  30.22 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.070586  normal  0.270658 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0691  hypothetical protein  30.51 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>