37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1900 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1900  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2265  hypothetical protein  63.53 
 
 		 198 aa  204  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349785 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2831  hypothetical protein  58.64 
 
 		 191 aa  197  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.674446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6722  hypothetical protein  59.43 
 
 		 198 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1762  hypothetical protein  55.56 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3675  hypothetical protein  50.82 
 
 		 209 aa  174  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408341  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1473  hypothetical protein  51.69 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84596  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1551  hypothetical protein  48 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16400  hypothetical protein  49.71 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1650  hypothetical protein  42.45 
 
 		 216 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000541072 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1891  hypothetical protein  47.54 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12695  hypothetical protein  47.78 
 
 		 261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000281154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1531  hypothetical protein  49.45 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.369957  normal  0.595416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1728  hypothetical protein  44.94 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674056  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1890  hypothetical protein  43.75 
 
 		 192 aa  147  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0098022  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1584  hypothetical protein  49.12 
 
 		 199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145773  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24100  hypothetical protein  48.57 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0403193  normal  0.0325887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2200  hypothetical protein  44.74 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.13428 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2257  hypothetical protein  44.74 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2211  hypothetical protein  44.74 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1888  hypothetical protein  48.31 
 
 		 209 aa  144  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3920  hypothetical protein  45.79 
 
 		 193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165223  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1657  hypothetical protein  41.38 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21151  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1386  hypothetical protein  45.05 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.260394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2480  hypothetical protein  45.79 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264009 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12950  hypothetical protein  44.44 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0681292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1332  hypothetical protein  40.4 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00477709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2262  hypothetical protein  43 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2553  hypothetical protein  42.7 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000429414  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3545  hypothetical protein  45.88 
 
 		 199 aa  130  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000113878  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1965  hypothetical protein  43.17 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116424  hitchhiker  0.0000364036 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15680  hypothetical protein  45.81 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101032  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5177  hypothetical protein  38.5 
 
 		 299 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6782  hypothetical protein  44.16 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13760  hypothetical protein  40.79 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1391  hypothetical protein  34.39 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.070586  normal  0.270658 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0691  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>