89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0304 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0304  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  206  1e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0779794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  54.74 
 
 
98 aa  110  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  54.74 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  54.74 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  55.79 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  55.79 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  55.79 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  55.79 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  55.79 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  54.74 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  54.74 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  54.74 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  54.74 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  53.68 
 
 
98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  53.68 
 
 
98 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2684  YCII-related  51.58 
 
 
98 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.112307  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  53.68 
 
 
98 aa  103  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  53.68 
 
 
98 aa  103  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  51.58 
 
 
98 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  51.58 
 
 
98 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  51.58 
 
 
98 aa  103  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02770  YciI-like protein  53.68 
 
 
98 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2261  YciI-like protein  49 
 
 
99 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003073  protein yciI  52.63 
 
 
98 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2138  YciI-like protein  50 
 
 
99 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1306  YciI-like protein  52.63 
 
 
98 aa  100  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000114962  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1639  YciI-like protein  50 
 
 
99 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  49 
 
 
99 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  49 
 
 
99 aa  100  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0705  YCII-related  45 
 
 
99 aa  100  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2835  YCII-related  50 
 
 
99 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  52.63 
 
 
98 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1994  YCII-related protein  52.63 
 
 
98 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1945  YCII-related  50.53 
 
 
98 aa  99.4  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  48 
 
 
99 aa  98.6  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1485  YciI-like protein  45 
 
 
99 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00728644  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1669  YciI-like protein  48 
 
 
99 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000851056  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  46 
 
 
99 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1504  YciI-like protein  47 
 
 
99 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244911  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1145  YciI-like protein  48 
 
 
100 aa  98.6  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2417  YciI-like protein  47 
 
 
99 aa  98.6  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.384464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3036  YciI-like protein  47 
 
 
99 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1514  YciI-like protein  47 
 
 
99 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00336778  normal  0.766184 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1448  YciI-like protein  47 
 
 
99 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127682  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1421  YciI-like protein  50 
 
 
99 aa  97.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2926  YciI-like protein  48 
 
 
99 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111785  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1924  YciI-like protein  44 
 
 
99 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914031  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  44 
 
 
99 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22780  YciI-like protein  44 
 
 
99 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.064842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4502  YciI-like protein  44 
 
 
99 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246147  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1410  YciI-like protein  44 
 
 
99 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0448344  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  47 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  45 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  46 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  44 
 
 
101 aa  94  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  51.76 
 
 
96 aa  94  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0718  YciI-like protein  45 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1466  YciI-like protein  49 
 
 
99 aa  94  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00060378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2688  YCII-related  47 
 
 
99 aa  93.6  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  44 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  46 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1645  hypothetical protein  44 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.290819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2815  YciI-like protein  44 
 
 
99 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000129416  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1650  YciI-like protein  44 
 
 
99 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239364  hitchhiker  0.0000000000431009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2714  YciI-like protein  44 
 
 
99 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0349915  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2262  YciI-like protein  43 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147649  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2736  YciI-like protein  44 
 
 
99 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000268578  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  40 
 
 
99 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2904  YCII-related  45 
 
 
100 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.087124  normal  0.332831 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  44.21 
 
 
98 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3398  YCII-related  44 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000326779  normal  0.427283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  44 
 
 
100 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  41 
 
 
99 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1233  YCII-related  43 
 
 
99 aa  87.8  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000791191  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  87.8  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1716  YciI-like protein  41 
 
 
99 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0666  YCII-related domain protein  50.62 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0815  YCII-related  48.84 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1269  YciI-like protein  45.26 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4008  YciI-like protein  45 
 
 
99 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594692  hitchhiker  0.000000962466 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00874  protein YciI  52.31 
 
 
86 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527512  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1987  YciI-like protein  37.37 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000630595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1699  YciI-like protein  35.35 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1975  YciI-like protein  34.34 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  33 
 
 
192 aa  62.8  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1459  YCII-related protein  37.33 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  26.26 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  26.26 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  25.25 
 
 
92 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>