28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5960 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5960  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.546785 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3811  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00812123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3830  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.070961  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3523  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  50 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5384  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  50.98 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.506576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1838  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  51 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0992  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  49.02 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7024  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  42.68 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211246  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2865  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  41.11 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0812  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  38.64 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1142  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  38 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.928351  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1544  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  40.91 
 
 		 101 aa  62  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3795  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  40.78 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0609  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.43 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5181  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4508  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35.96 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491741  normal  0.208752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0234  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  39.58 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2684  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2816  hypothetical protein  34 
 
 		 108 aa  48.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2904  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.507407  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0686  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.31 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.761017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1640  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  36.05 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3617  hypothetical protein  27.17 
 
 		 228 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0984  hypothetical protein  32.26 
 
 		 106 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3503  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  37.5 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1877  EthD  29.35 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3594  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.33 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0370  hypothetical protein  30.12 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>