30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03400 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0114  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 280 aa  566  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03449  lyase containing HEAT-repeat protein  100 
 
 		 280 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03400  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0119  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  566  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.537709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4093  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  566  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.403829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3801  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  566  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.334713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5173  hypothetical protein  36.52 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.334209  normal  0.0119948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  28.35 
 
 		 1148 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1094 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  25.97 
 
 		 958 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.81 
 
 		 1343 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.5 
 
 		 323 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  23.49 
 
 		 1328 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 		 593 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  25.18 
 
 		 644 aa  49.3  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6702  Ankyrin repeat-domain-containing protein-like protein  22.83 
 
 		 482 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.142315  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.42 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.53 
 
 		 666 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.82 
 
 		 333 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  25 
 
 		 501 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  27.95 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.1 
 
 		 831 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.09 
 
 		 224 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2754  HEAT domain containing protein  26.79 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202465  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  26.54 
 
 		 959 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.78 
 
 		 510 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.65 
 
 		 331 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.65 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.29 
 
 		 1438 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>