19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2617 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2617  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  339  9e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3332  ATP synthase I  73.55 
 
 
160 aa  233  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2205  ptuative ATP synthase protein I  68.03 
 
 
146 aa  176  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2625  ATP synthase I  55.88 
 
 
149 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1486  ATP synthase I  62.39 
 
 
114 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.187265  normal  0.492914 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0330  hypothetical protein  45.33 
 
 
168 aa  130  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.214626  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3389  ATP synthase I  50 
 
 
138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000623552  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2714  ATP synthase I  49.22 
 
 
138 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0482  ATP synthase protein 1  35.09 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.64166  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2194  ATP synthase protein 1  35.24 
 
 
112 aa  72  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1550  ATP synthase subunit 1-like  32.43 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16591  ATP synthase subunit 1  34.26 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16471  ATP synthase subunit 1  32.43 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0649609  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16361  ATP synthase subunit 1  28.93 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15761  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.51 
 
 
124 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04761  H+-transporting ATP synthase  34.81 
 
 
206 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18551  H+-transporting ATP synthase  31.68 
 
 
139 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0819947  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0987  uncharacterized membrane protein  31.68 
 
 
139 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_27966  predicted protein  23.73 
 
 
336 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.433937  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>