18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2714 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2714  ATP synthase I  100 
 
 
138 aa  276  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3389  ATP synthase I  98.55 
 
 
138 aa  273  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000623552  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2625  ATP synthase I  62.31 
 
 
149 aa  169  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3332  ATP synthase I  53.6 
 
 
160 aa  144  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2205  ptuative ATP synthase protein I  47.79 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1486  ATP synthase I  54.95 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.187265  normal  0.492914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2617  hypothetical protein  49.22 
 
 
167 aa  127  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0330  hypothetical protein  52.21 
 
 
168 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.214626  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0482  ATP synthase protein 1  40.18 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.64166  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2194  ATP synthase protein 1  39.29 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15761  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.48 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16471  ATP synthase subunit 1  28.89 
 
 
158 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0649609  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16591  ATP synthase subunit 1  35.85 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1550  ATP synthase subunit 1-like  28.89 
 
 
158 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16361  ATP synthase subunit 1  31.3 
 
 
159 aa  50.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18551  H+-transporting ATP synthase  37.27 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0819947  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0987  uncharacterized membrane protein  37.27 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04761  H+-transporting ATP synthase  38.68 
 
 
206 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>