18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0330 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0330  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  337  4e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.214626  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2625  ATP synthase I  46.5 
 
 
149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2205  ptuative ATP synthase protein I  48.2 
 
 
146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1486  ATP synthase I  50.44 
 
 
114 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.187265  normal  0.492914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2617  hypothetical protein  49.66 
 
 
167 aa  121  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3332  ATP synthase I  41.72 
 
 
160 aa  117  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2714  ATP synthase I  48.82 
 
 
138 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3389  ATP synthase I  48.82 
 
 
138 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000623552  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0482  ATP synthase protein 1  40.95 
 
 
122 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.64166  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2194  ATP synthase protein 1  40 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16471  ATP synthase subunit 1  24.68 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0649609  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1550  ATP synthase subunit 1-like  26.03 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16591  ATP synthase subunit 1  29.82 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16361  ATP synthase subunit 1  29.63 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15761  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.73 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18551  H+-transporting ATP synthase  33.33 
 
 
139 aa  61.6  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0819947  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0987  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 
139 aa  61.6  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04761  H+-transporting ATP synthase  33.86 
 
 
206 aa  51.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>