18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2194 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2194  ATP synthase protein 1  100 
 
 
112 aa  214  5e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0482  ATP synthase protein 1  92.79 
 
 
122 aa  197  3e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.64166  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16361  ATP synthase subunit 1  35.58 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16471  ATP synthase subunit 1  36.54 
 
 
158 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0649609  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1550  ATP synthase subunit 1-like  35.58 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04761  H+-transporting ATP synthase  56.19 
 
 
206 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16591  ATP synthase subunit 1  35.58 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15761  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.62 
 
 
124 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0330  hypothetical protein  40 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.214626  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0987  uncharacterized membrane protein  44.23 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18551  H+-transporting ATP synthase  44.23 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0819947  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2625  ATP synthase I  38.1 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1486  ATP synthase I  34.29 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.187265  normal  0.492914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2617  hypothetical protein  35.24 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2205  ptuative ATP synthase protein I  33.33 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3332  ATP synthase I  30.48 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2714  ATP synthase I  39.29 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3389  ATP synthase I  39.29 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000623552  normal  0.801599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>