13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0610 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0610  glycoside hydrolase starch-binding  100 
 
 
637 aa  1277    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  48.15 
 
 
1847 aa  89  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  45.56 
 
 
1401 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  42.98 
 
 
1136 aa  77.4  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  43.9 
 
 
1401 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  40.45 
 
 
1307 aa  63.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0947  hypothetical protein  40.66 
 
 
149 aa  63.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6337  putative esterase  37.23 
 
 
434 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0083  putative esterase  40.43 
 
 
379 aa  57  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  35.23 
 
 
1753 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4810  putative esterase  28.83 
 
 
363 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4527  putative esterase  30.38 
 
 
358 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.859606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3690  putative esterase  33.33 
 
 
441 aa  43.9  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0739014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>