11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0947 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0947  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  302  8.000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  36.84 
 
 
1307 aa  63.5  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0610  glycoside hydrolase starch-binding  40.66 
 
 
637 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0083  putative esterase  39.6 
 
 
379 aa  57.4  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6337  putative esterase  29.41 
 
 
434 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  34.15 
 
 
1847 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  35.96 
 
 
1136 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  28.7 
 
 
1401 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  28 
 
 
1401 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4810  putative esterase  32.93 
 
 
363 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  28.3 
 
 
654 aa  41.2  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>