More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0858 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0858  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  100 
 
 
170 aa  349  1e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1373  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.43 
 
 
164 aa  155  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0946662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4385  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.73 
 
 
163 aa  155  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3605  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.39 
 
 
162 aa  153  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4095  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.41 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277222  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2081  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.57 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.08622  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1578  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.39 
 
 
165 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0742477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.39 
 
 
168 aa  150  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0516  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.77 
 
 
159 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.266942  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1134  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.77 
 
 
162 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471716  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0923  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.37 
 
 
159 aa  149  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4033  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.53 
 
 
160 aa  148  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05610  Phosphopantetheine adenylyltransferase  47.44 
 
 
176 aa  148  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  normal  0.709032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0298  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50.64 
 
 
159 aa  147  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49145  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4765  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.44 
 
 
167 aa  147  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1880  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.94 
 
 
160 aa  147  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641897  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0380  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.4 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.848582  hitchhiker  0.0082896 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0065  phosphopantetheine adenylyltransferase  45 
 
 
159 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000149443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4151  phosphopantetheine adenylyltransferase  45 
 
 
159 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000257789  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1879  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.69 
 
 
165 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0979475  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1564  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  43.75 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0286  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.3 
 
 
184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106177  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2783  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.12 
 
 
158 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0449277  normal  0.117453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2839  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.3 
 
 
165 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.601234  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3516  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.3 
 
 
165 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0059  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.38 
 
 
159 aa  145  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000113354  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0186  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.68 
 
 
162 aa  145  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2006  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.57 
 
 
169 aa  144  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1097  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.03 
 
 
156 aa  144  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3956  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.3 
 
 
159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.265028  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0105  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.95 
 
 
159 aa  144  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00317746  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0004  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.28 
 
 
162 aa  143  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03491  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.59 
 
 
159 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  43.59 
 
 
159 aa  143  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3843  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.59 
 
 
159 aa  143  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1227  phosphopantetheine adenylyltransferase  46 
 
 
167 aa  143  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4135  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.59 
 
 
159 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0163  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.95 
 
 
159 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.59 
 
 
159 aa  143  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.59 
 
 
159 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4059  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.59 
 
 
159 aa  143  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000154368  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1871  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.1 
 
 
160 aa  143  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.59 
 
 
159 aa  143  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03443  hypothetical protein  43.59 
 
 
159 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0511611  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4005  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.16 
 
 
159 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0403849  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3924  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.16 
 
 
159 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00616053  hitchhiker  0.00140553 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1783  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.23 
 
 
170 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0795216  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4051  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.16 
 
 
159 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.979837  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10020  Phosphopantetheine adenylyltransferase  46.2 
 
 
159 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000130207  hitchhiker  0.000000322675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09450  Phosphopantetheine adenylyltransferase  43.75 
 
 
160 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4112  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.16 
 
 
159 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.017297  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1270  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.44 
 
 
156 aa  141  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.164071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0076  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.05 
 
 
158 aa  141  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.697492 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2655  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.59 
 
 
174 aa  141  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0121775 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3642  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  44.72 
 
 
160 aa  141  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3942  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.51 
 
 
159 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.137281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0648  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.59 
 
 
164 aa  140  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1282  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.62 
 
 
162 aa  140  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.730863  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1732  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.94 
 
 
164 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0110  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.88 
 
 
189 aa  140  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.800905  normal  0.0383495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3599  CheW protein  44.38 
 
 
181 aa  140  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0853169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2205  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.94 
 
 
164 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2115  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.94 
 
 
164 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1243  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.16 
 
 
164 aa  140  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0256  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.37 
 
 
162 aa  140  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.444043  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0173  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.23 
 
 
253 aa  140  9e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000768872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3436  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  43.67 
 
 
160 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.742639  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3502  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.16 
 
 
166 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000195906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1930  coenzyme A biosynthesis protein  46.75 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0452277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1206  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.67 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361854  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0359  coenzyme A biosynthesis protein  44.1 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.127481 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1184  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.67 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0454374  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0668  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.77 
 
 
160 aa  140  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3283  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  43.75 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0392  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.52 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.147516  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1550  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.12 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0805117  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1925  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.38 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551466  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1793  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.52 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.162855  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0268  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.52 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.526112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1759  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.87 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282683  normal  0.0728276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2935  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1945  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.83 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1982  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.58 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1700  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.58 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.880065  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0091  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  43.51 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1991  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.38 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0298  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.87 
 
 
162 aa  138  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3699  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.16 
 
 
165 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0134163  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3692  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.94 
 
 
158 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5968  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.41 
 
 
160 aa  138  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.03 
 
 
163 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1172  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.1 
 
 
158 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170767  hitchhiker  0.00000516362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.77 
 
 
160 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3869  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.15 
 
 
167 aa  138  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4368  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.91 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2309  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.03 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0326  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.48 
 
 
170 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.688108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2500  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.49 
 
 
162 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000197765  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03490  phosphopantetheine adenylyltransferase  44 
 
 
159 aa  137  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1372  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  43.95 
 
 
165 aa  137  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>