More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3605 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3605  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
162 aa  332  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1134  phosphopantetheine adenylyltransferase  85.71 
 
 
162 aa  286  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471716  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1578  phosphopantetheine adenylyltransferase  70 
 
 
165 aa  233  9e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0742477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3436  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  67.9 
 
 
160 aa  230  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.742639  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09450  Phosphopantetheine adenylyltransferase  66.67 
 
 
160 aa  224  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5968  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  66.67 
 
 
160 aa  223  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2783  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  65 
 
 
158 aa  218  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0449277  normal  0.117453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1282  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.62 
 
 
162 aa  214  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.730863  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7998  Pantetheine-phosphate adenylyltransferase  62.5 
 
 
158 aa  208  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248261  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4033  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  64.38 
 
 
160 aa  207  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1172  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.52 
 
 
158 aa  205  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170767  hitchhiker  0.00000516362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0648  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.79 
 
 
164 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1879  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  61.88 
 
 
165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0979475  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0209  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  58.64 
 
 
164 aa  192  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1564  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  56.52 
 
 
157 aa  189  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2118  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  60 
 
 
173 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.477791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1925  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.88 
 
 
158 aa  187  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551466  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1991  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.88 
 
 
158 aa  187  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1945  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.88 
 
 
170 aa  186  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1872  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.86 
 
 
164 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2167  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.52 
 
 
160 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1000  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.6 
 
 
169 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000348032  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4196  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.32 
 
 
160 aa  184  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3283  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  57.14 
 
 
159 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12980  phosphopantetheine adenylyltransferase  55 
 
 
161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8023  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  61.73 
 
 
170 aa  177  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2243  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.14 
 
 
166 aa  173  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000965744 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2632  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.43 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000126896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1210  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.43 
 
 
163 aa  171  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0561592  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3756  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.43 
 
 
163 aa  171  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4030  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.43 
 
 
163 aa  171  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0157676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1227  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.94 
 
 
167 aa  170  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4041  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.43 
 
 
163 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000581015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3976  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.43 
 
 
163 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3841  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.43 
 
 
163 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3671  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.43 
 
 
163 aa  169  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0440326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3688  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.43 
 
 
163 aa  169  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.756476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4139  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.43 
 
 
163 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0668  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.53 
 
 
160 aa  169  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3943  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.43 
 
 
163 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2504  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.14 
 
 
159 aa  169  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.687029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1880  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.45 
 
 
160 aa  166  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2069  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  53.12 
 
 
167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10140  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  51.25 
 
 
162 aa  164  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.089106  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1142  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.2 
 
 
160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2205  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.05 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1640  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.62 
 
 
166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000016077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2115  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.05 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3308  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.12 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0188  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.55 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0127125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2500  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.5 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000197765  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1514  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  55.28 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.552696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1732  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.05 
 
 
164 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0567  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.66 
 
 
167 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.631239  normal  0.0587686 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1736  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.85 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1276  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 
159 aa  160  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000385015  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0186  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.93 
 
 
161 aa  160  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.69 
 
 
166 aa  159  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.71709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1243  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.2 
 
 
164 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1982  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.53 
 
 
164 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1700  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.83 
 
 
164 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.880065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2741  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.44 
 
 
168 aa  158  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3699  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  52.12 
 
 
165 aa  158  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0134163  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0633  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.38 
 
 
163 aa  158  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1372  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  51.57 
 
 
167 aa  157  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2065  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.07 
 
 
165 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0496665  normal  0.697184 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0332  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.24 
 
 
182 aa  156  9e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4385  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.43 
 
 
163 aa  156  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1966  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.1 
 
 
212 aa  156  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.217223  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0516  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.43 
 
 
159 aa  156  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.266942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2839  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.75 
 
 
165 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.601234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1871  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.25 
 
 
160 aa  155  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1107  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  51.55 
 
 
166 aa  155  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.371487  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0286  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.2 
 
 
184 aa  155  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106177  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3956  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.8 
 
 
159 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.265028  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3516  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.75 
 
 
165 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1671  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.83 
 
 
160 aa  155  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0669153  hitchhiker  0.0099095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2992  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.12 
 
 
168 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3034  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.12 
 
 
168 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.677052  normal  0.536171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0903  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  55.78 
 
 
183 aa  155  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4095  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.43 
 
 
159 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1759  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.38 
 
 
163 aa  154  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282683  normal  0.0728276 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2081  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50.96 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.08622  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1322  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45 
 
 
163 aa  154  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.125584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2007  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.9 
 
 
166 aa  154  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1373  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.2 
 
 
164 aa  154  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0946662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1168  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.77 
 
 
165 aa  153  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  0.219485 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0858  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.39 
 
 
170 aa  153  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1337  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  52.35 
 
 
165 aa  152  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1930  coenzyme A biosynthesis protein  50.96 
 
 
159 aa  152  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0657875  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0699  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.2 
 
 
161 aa  153  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000151167  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0715  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.43 
 
 
161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.429176  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0380  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.4 
 
 
160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.848582  hitchhiker  0.0082896 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1184  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.1 
 
 
160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0454374  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1206  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.1 
 
 
160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361854  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.7 
 
 
168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1037  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.15 
 
 
166 aa  150  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0004  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  51.33 
 
 
162 aa  150  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2655  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.31 
 
 
174 aa  150  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0121775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0066  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.06 
 
 
162 aa  150  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>