43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0823 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0823  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 433 aa  884    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.596738  hitchhiker  0.000464353 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2217  galactose/glucose-binding lipoprotein  46.51 
 
 		 403 aa  347  3e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1061  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.54 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0942  D-galactose/D-glucose ABC transporter, periplasmic D-galactose/D-glucose-binding protein  31.56 
 
 		 324 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.997032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1563  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.7 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3017  galactose-binding protein  31.02 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.013396 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.02 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2467  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  31.02 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2995  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.95 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2429  D-galactose-binding periplasmic protein  30.61 
 
 		 332 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2381  D-galactose-binding periplasmic protein  30.61 
 
 		 332 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2425  D-galactose-binding periplasmic protein  30.61 
 
 		 332 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2336  D-galactose-binding periplasmic protein  30.61 
 
 		 332 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.777429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3283  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  29.74 
 
 		 332 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2297  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  29.74 
 
 		 332 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.897545  hitchhiker  0.00310991 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1498  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.74 
 
 		 332 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2284  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  29.74 
 
 		 332 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2445  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  29.74 
 
 		 332 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1508  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.74 
 
 		 332 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944041  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0816  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  29.74 
 
 		 332 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.685859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1702  galactose-binding protein  31.4 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2327  galactose/glucose-binding protein  27.27 
 
 		 350 aa  87  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2329  galactose/glucose-binding protein  28.29 
 
 		 342 aa  87  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0801  putative galactoside ABC transporter  27.89 
 
 		 342 aa  86.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.269097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2750  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.16 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1341  d-galactose-binding periplasmic protein precursor  28.8 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000193689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1548  putative galactoside ABC transporter, galactoside-binding protein  28 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00850993  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0317  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.71 
 
 		 332 aa  76.3  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2243  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.29 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2328  galactose/glucose-binding protein  23.05 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2330  galactose/glucose-binding protein  22.18 
 
 		 337 aa  51.2  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.783763  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2807  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.34 
 
 		 351 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2780  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.34 
 
 		 351 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2824  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.34 
 
 		 351 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0298901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2781  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.32 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2825  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.32 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.0535027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2808  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.32 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1457  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.63 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1132  solute-binding protein  24.77 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346774 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.65 
 
 		 315 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2044  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.35 
 
 		 358 aa  43.9  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4011  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.51 
 
 		 319 aa  43.9  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1684  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.51 
 
 		 313 aa  43.1  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal  0.351536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>