88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2217 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2217  galactose/glucose-binding lipoprotein  100 
 
 		 403 aa  818    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0823  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  46.51 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.596738  hitchhiker  0.000464353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1563  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  116  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1061  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.63 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1341  d-galactose-binding periplasmic protein precursor  34.16 
 
 		 354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000193689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1548  putative galactoside ABC transporter, galactoside-binding protein  34.5 
 
 		 354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00850993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3283  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  33.91 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2284  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  33.91 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2445  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  33.91 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1508  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.91 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944041  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2297  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  33.91 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.897545  hitchhiker  0.00310991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2425  D-galactose-binding periplasmic protein  33.19 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2336  D-galactose-binding periplasmic protein  33.19 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.777429  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2381  D-galactose-binding periplasmic protein  32.19 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2995  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.18 
 
 		 331 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0816  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  33.91 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.685859  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2429  D-galactose-binding periplasmic protein  32.19 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1498  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.48 
 
 		 332 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2329  galactose/glucose-binding protein  31.25 
 
 		 342 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.3 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2467  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  32.3 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3017  galactose-binding protein  32.3 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.013396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2750  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.17 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0942  D-galactose/D-glucose ABC transporter, periplasmic D-galactose/D-glucose-binding protein  33.48 
 
 		 324 aa  106  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.997032  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2327  galactose/glucose-binding protein  32.1 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0801  putative galactoside ABC transporter  29.18 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.269097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0317  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.75 
 
 		 332 aa  101  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1702  galactose-binding protein  33.64 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2243  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.46 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2328  galactose/glucose-binding protein  29.26 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2330  galactose/glucose-binding protein  24.59 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.783763  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4011  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.5 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3049  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding, putative  24.71 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00910782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50130  Periplasmic substrate-binding protein of sugar ABC transporter  26.36 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2395  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.97 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1961  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.11 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2807  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.14 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2824  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.14 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0298901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2780  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.14 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585093  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50140  Periplasmic substrate-binding protein of sugar ABC transporter  24.21 
 
 		 310 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2825  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.14 
 
 		 349 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.0535027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2808  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.14 
 
 		 349 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2781  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.14 
 
 		 349 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1101  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  24.81 
 
 		 297 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0810  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  24.81 
 
 		 297 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.22 
 
 		 313 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.81 
 
 		 297 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2074  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  24.81 
 
 		 297 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1793  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  24.81 
 
 		 342 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1642  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.88 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000807495  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0362  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  24.81 
 
 		 342 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2044  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.6 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0457  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  35.79 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1684  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.47 
 
 		 313 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2824  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.88 
 
 		 281 aa  50.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3856  Monosaccharide-transporting ATPase  23.56 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0772543  normal  0.188822 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5353  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.66 
 
 		 309 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.338123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4971  Monosaccharide-transporting ATPase  23.56 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.155709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1581  ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.15 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0249545  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4184  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0155  D-xylose ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.67 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6693  solute-binding protein  34.07 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4268  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.44 
 
 		 309 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1574  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  26.84 
 
 		 329 aa  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4893  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.56 
 
 		 309 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3490  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.42 
 
 		 309 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.18 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1630  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  26.84 
 
 		 329 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0054  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.11 
 
 		 309 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1582  ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.59 
 
 		 311 aa  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000317911  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4065  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.32 
 
 		 305 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.870399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1399  rhizopine-binding protein precursor  28.64 
 
 		 328 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000528006  normal  0.827429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2569  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.64 
 
 		 336 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4198  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.81 
 
 		 308 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1457  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.19 
 
 		 362 aa  46.6  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2771  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.96 
 
 		 314 aa  46.6  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.789772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4067  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.37 
 
 		 329 aa  46.6  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0151386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3313  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.55 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5068  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.64 
 
 		 309 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.449495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0158  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  32.18 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000066936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3265  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.95 
 
 		 311 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0610984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3164  Monosaccharide-transporting ATPase  37.31 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0812  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.18 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0812  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.18 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2685  Monosaccharide-transporting ATPase  41.82 
 
 		 306 aa  43.5  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.450778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1964  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.12 
 
 		 305 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2473  periplasmic substrate-binding protein  22.94 
 
 		 306 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.265832  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2379  hypothetical protein  28.18 
 
 		 370 aa  43.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.625512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>