16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1940 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1940  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  314  2e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.473224  normal  0.0765452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2148  hypothetical protein  32.69 
 
 
166 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.8454  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3280  hypothetical protein  31.4 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3105  hypothetical protein  27.62 
 
 
179 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1744  hypothetical protein  31.43 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4848  Protein of unknown function DUF1790  33.72 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3881  hypothetical protein  32.05 
 
 
179 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.832488  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2513  hypothetical protein  26.67 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4170  hypothetical protein  32.05 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2115  hypothetical protein  21.21 
 
 
296 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1407  hypothetical protein  26.67 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.246502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0854  hypothetical protein  32.22 
 
 
167 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1376  Protein of unknown function DUF1790  31.11 
 
 
167 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2756  Protein of unknown function DUF1790  29.27 
 
 
166 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3019  Protein of unknown function DUF1790  29.27 
 
 
166 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3169  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  40.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>