70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0266 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0266  ribosomal protein L32  100 
 
 
63 aa  129  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00516678  normal  0.789873 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 
57 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 
59 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  41.67 
 
 
57 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  41.67 
 
 
57 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 
61 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
57 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
57 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1275  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00245853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  40.32 
 
 
60 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0667  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.728717  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
58 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4030  ribosomal protein L32  46.3 
 
 
59 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0637  50S ribosomal protein L32  42.31 
 
 
59 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000215733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1137  50S ribosomal protein L32  43.86 
 
 
56 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131577  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1646  ribosomal protein L32  43.75 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  40 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 
58 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1086  50S ribosomal protein L32  41.27 
 
 
72 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0233  50S ribosomal protein L32  42.62 
 
 
60 aa  43.5  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000487517  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1058  ribosomal protein L32  41.27 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000694342  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2559  ribosomal protein L32  38.18 
 
 
60 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 
60 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  42 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  39.66 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0335  ribosomal protein L32  39.66 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  39.66 
 
 
57 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf408  ribosomal protein L32  39.22 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2274  ribosomal protein L32  41.38 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2805  ribosomal protein L32  40.98 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  38.71 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0916  50S ribosomal protein L32  37.1 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  38.71 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1859  50S ribosomal protein L32  34.43 
 
 
68 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898391  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 
60 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0386  50S ribosomal protein L32  36.84 
 
 
59 aa  41.6  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0173336  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1608  50S ribosomal protein L32  37.93 
 
 
66 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233748  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  38.1 
 
 
61 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1643  50S ribosomal protein L32P  43.55 
 
 
59 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510247  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  34.92 
 
 
67 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_002950  PG2140  50S ribosomal protein L32  44.9 
 
 
61 aa  41.2  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  37.7 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  37.7 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1174  ribosomal protein L32  41.07 
 
 
57 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000264274  normal  0.0273197 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  37.93 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3692  ribosomal protein L32  33.9 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  36.21 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  36.21 
 
 
59 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0211  ribosomal protein L32  44.44 
 
 
58 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1025  50S ribosomal protein L32  37.29 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103246  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0656  ribosomal protein L32  44 
 
 
59 aa  40.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1259  50S ribosomal protein L32  40.38 
 
 
58 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760142  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  36.21 
 
 
59 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1376  50S ribosomal protein L32  39.68 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.179787  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2294  ribosomal protein L32  41.38 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252255  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2844  50S ribosomal protein L32  44 
 
 
59 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1667  50S ribosomal protein L32  39.06 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.294477  normal  0.0177766 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2752  50S ribosomal protein L32  44 
 
 
59 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2936  50S ribosomal protein L32  44 
 
 
59 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>