15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6725 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6725  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6724  hypothetical protein  46.6 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4790  hypothetical protein  32.26 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668183  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0921  hypothetical protein  35.25 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3095  hypothetical protein  28.95 
 
 		 277 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3295  hypothetical protein  32.8 
 
 		 300 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3051  hypothetical protein  34.07 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6726  hypothetical protein  37.14 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16850  hypothetical protein  32.33 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.034716  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6723  hypothetical protein  32.33 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0922  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1806  hypothetical protein  42 
 
 		 685 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  49.09 
 
 		 959 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  49.09 
 
 		 990 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  45.45 
 
 		 964 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>