28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3295 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3295  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3095  hypothetical protein  49.37 
 
 
277 aa  239  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3296  hypothetical protein  51.07 
 
 
270 aa  205  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17990  hypothetical protein  30.07 
 
 
241 aa  62.4  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04790  hypothetical protein  34.57 
 
 
201 aa  60.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4790  hypothetical protein  31.76 
 
 
226 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668183  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3051  hypothetical protein  30.62 
 
 
219 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0922  hypothetical protein  36.47 
 
 
236 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16850  hypothetical protein  30.51 
 
 
176 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.034716  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  30 
 
 
514 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0409  hypothetical protein  34.18 
 
 
527 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282348  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6723  hypothetical protein  33.56 
 
 
172 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02890  hypothetical protein  29.38 
 
 
186 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0110801  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  26.61 
 
 
1646 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0921  hypothetical protein  30.77 
 
 
203 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0938  hypothetical protein  53.85 
 
 
224 aa  49.7  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  34.04 
 
 
2179 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  36.98 
 
 
207 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  30.07 
 
 
470 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3999  hypothetical protein  41.89 
 
 
131 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  30.3 
 
 
190 aa  45.4  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1912  Allergen V5/Tpx-1 related  43.94 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3438  hypothetical protein  33.78 
 
 
188 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  31.96 
 
 
2272 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  20.71 
 
 
3409 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  29.46 
 
 
3242 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  32.69 
 
 
1560 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.712713 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02012  RfeF [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J174]  42.34 
 
 
524 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00625491  normal  0.354212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>