10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6723 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6723  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  338  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3295  hypothetical protein  34 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02890  hypothetical protein  29.94 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0110801  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4790  hypothetical protein  28.8 
 
 		 226 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668183  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1469  hypothetical protein  29.78 
 
 		 240 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000606848  normal  0.0260491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3095  hypothetical protein  26.67 
 
 		 277 aa  45.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6725  hypothetical protein  29.11 
 
 		 205 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0921  hypothetical protein  30.36 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0681  hypothetical protein  29.87 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0694  hypothetical protein  29.87 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.117336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>