13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2823 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 510 aa  1010    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836124  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  35.71 
 
 		 412 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.3 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  35 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  35 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  35 
 
 		 412 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  35 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  35.04 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898295 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  34.09 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  31.51 
 
 		 540 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  56.25 
 
 		 713 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  25.6 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>