13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0823 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0823  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  959    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111949  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06640  hypothetical protein  46.42 
 
 		 451 aa  307  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4677  hypothetical protein  38.14 
 
 		 378 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.226091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3516  hypothetical protein  35.79 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13238  hypothetical protein  36.29 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.734332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1790  hypothetical protein  35.78 
 
 		 403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.244809  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1392  hypothetical protein  34.57 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1410  hypothetical protein  34.57 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.615551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1446  hypothetical protein  34.65 
 
 		 403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1115  hypothetical protein  31.8 
 
 		 412 aa  146  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0278594  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2166  hypothetical protein  34.35 
 
 		 480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00102864  hitchhiker  0.000639189 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0655  Pericardin like protein  45.59 
 
 		 684 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.541208  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6372  glycosyl transferase family protein  48.72 
 
 		 600 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>