12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3516 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3516  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  824    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06640  hypothetical protein  38.62 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4677  hypothetical protein  37.15 
 
 		 378 aa  199  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.226091 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1115  hypothetical protein  35.45 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0278594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0823  hypothetical protein  36.08 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1790  hypothetical protein  35.95 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.244809  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13238  hypothetical protein  34.29 
 
 		 407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.734332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1392  hypothetical protein  35.66 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1410  hypothetical protein  35.66 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.615551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1446  hypothetical protein  35.9 
 
 		 403 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2166  hypothetical protein  32.51 
 
 		 480 aa  69.7  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00102864  hitchhiker  0.000639189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4255  hypothetical protein  27.2 
 
 		 373 aa  47  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0105879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>