42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0014 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0014  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0346111  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0038  tRNA-His  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000137357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0082  tRNA-His  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0017  tRNA-His  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000374304  hitchhiker  0.000000156779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0031  tRNA-His  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000176121  normal  0.0395456 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0057  tRNA-Arg  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00400024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0006  tRNA-His  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105262  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0019  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230793  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0019  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464578  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0034  tRNA-His  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1761  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2040  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000158642  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0045  tRNA-His  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0016  tRNA-His  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0319079  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1468  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0006  tRNA-His  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119779  hitchhiker  0.0000201498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0053  tRNA-His  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0024  tRNA-His  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.62576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0051  tRNA-His  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000083549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0064  tRNA-His  85.71 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000223288  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0063  tRNA-His  85.71 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000214057  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0052  tRNA-His  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0296253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0043  tRNA-His  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.130453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0041  tRNA-His  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.137953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0046  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.590376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3503  tRNA-His  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0066  tRNA-His  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308433  normal  0.0175019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0064  tRNA-His  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540821  normal  0.0431987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3505  tRNA-His  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0058  tRNA-His  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606593  hitchhiker  0.000424792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0056  tRNA-His  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441531  hitchhiker  0.000421816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0040  tRNA-His  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.262855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0016  tRNA-His  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.33811 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0264  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000581931  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0071  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000022788  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0032  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0010  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0071  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000447795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0032  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000435638  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>