16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1239 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1239  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  450  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5064  peptidase M50  34.32 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0650927  normal  0.0347962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1451  hypothetical protein  36.27 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  31.25 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  29.05 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  31.33 
 
 
226 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  30.86 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  25.63 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1362  peptidase M50  30.49 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  27.09 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  26.86 
 
 
207 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  37.04 
 
 
260 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  27.75 
 
 
224 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  45.61 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  26.88 
 
 
211 aa  41.6  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  31.06 
 
 
226 aa  41.6  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>