575 genes were found for organism Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bphy_7247    NC_010627  361  656  +  296      normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7248    NC_010627  806  1007  -  202      normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7249    NC_010627  1773  3154  +  1382      normal  1  normal  0.701418  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7250    NC_010627  3283  3604  +  322      normal  0.442963  normal  0.572494  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7251  CDS  NC_010627  3757  4803  -  1047  hydrogenase expression/formation protein HypE  YP_001863295  normal  0.669348  normal  0.687973  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7252  CDS  NC_010627  4800  5930  -  1131  hydrogenase expression/formation protein HypD  YP_001863296  normal  0.530121  normal  0.519076  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7253  CDS  NC_010627  5927  6193  -  267  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  YP_001863297  normal  1  normal  0.401886  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7254  CDS  NC_010627  6207  8516  -  2310  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  YP_001863298  normal  1  normal  0.293278  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7255  CDS  NC_010627  8503  9381  -  879  hydrogenase accessory protein HypB  YP_001863299  normal  0.634166  normal  0.351792  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7256  CDS  NC_010627  9531  9872  -  342  hydrogenase expression/synthesis HypA  YP_001863300  normal  0.492993  normal  0.319933  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7257  CDS  NC_010627  9865  10875  -  1011  HupK protein  YP_001863301  normal  0.53403  normal  0.383588  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7258  CDS  NC_010627  10872  11552  -  681  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  YP_001863302  normal  0.453683  normal  0.45859  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7259  CDS  NC_010627  11552  12430  -  879  HupH hydrogenase expression protein  YP_001863303  normal  0.302833  normal  0.611247  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7260  CDS  NC_010627  12427  12873  -  447  hydrogenase-1 expression HyaE  YP_001863304  normal  0.352807  normal  0.532049  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7261  CDS  NC_010627  12870  13178  -  309  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  YP_001863305  normal  0.409873  normal  0.408688  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7262  CDS  NC_010627  13178  13822  -  645  hydrogenase expression/formation protein  YP_001863306  normal  1  normal  0.356245  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7263  CDS  NC_010627  13826  14536  -  711  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  YP_001863307  normal  0.73881  normal  0.356245  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7264  CDS  NC_010627  14570  16360  -  1791  nickel-dependent hydrogenase large subunit  YP_001863308  normal  1  normal  0.340015  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7265  CDS  NC_010627  16357  17517  -  1161  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  YP_001863309  normal  0.530121  normal  0.303064  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7266  CDS  NC_010627  18316  19584  +  1269  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  YP_001863310  normal  0.0472603  normal  0.53872  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7267  CDS  NC_010627  20170  20457  +  288  hypothetical protein  YP_001863311  normal  0.0995565  normal  0.697547  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7268  CDS  NC_010627  20465  21085  +  621  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001863312  normal  0.114808  normal  0.363594  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7269  CDS  NC_010627  21082  21552  +  471  hypothetical protein  YP_001863313  normal  0.0174157  normal  0.350085  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7270  CDS  NC_010627  21554  22141  +  588  isochorismatase hydrolase  YP_001863314  normal  0.0591041  normal  0.365805  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7271  CDS  NC_010627  22224  23249  +  1026  hydrogenase expression/formation protein HypE  YP_001863315  normal  0.0520113  normal  0.413244  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7272  CDS  NC_010627  23243  25618  +  2376  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  YP_001863316  normal  0.640566  normal  0.270214  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7273    NC_010627  25718  26072  +  355      normal  0.260286  normal  0.158226  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7274    NC_010627  26396  29036  -  2641      normal  1  normal  0.107236  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7275  CDS  NC_010627  27237  28565  +  1329  transposase IS4 family protein  YP_001863317  normal  1  normal  0.200295  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7276  CDS  NC_010627  29593  30603  +  1011  yecA family protein  YP_001863318  normal  1  normal  0.106691  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7277  CDS  NC_010627  30838  33516  +  2679  non-specific serine/threonine protein kinase  YP_001863319  normal  1  normal  0.0554781  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7278  CDS  NC_010627  33535  34536  +  1002  zinc finger, SWIM-type  YP_001863320  normal  1  normal  0.0502304  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7279  CDS  NC_010627  34949  35266  -  318  CcdB-like toxin protein  YP_001863321  normal  0.66787  normal  0.0280543  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7280  CDS  NC_010627  35266  35508  -  243  post-segregation antitoxin CcdA  YP_001863322  normal  0.427853  normal  0.0277353  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7281    NC_010627  35587  36035  -  449      normal  0.297395  normal  0.0441457  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7282    NC_010627  36061  36371  -  311      normal  0.194441  normal  0.0424045  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7283  CDS  NC_010627  37055  38140  +  1086  hypothetical protein  YP_001863323  normal  0.0877183  normal  0.0144014  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7284  CDS  NC_010627  38130  38342  +  213  hypothetical protein  YP_001863324  normal  0.0429953  normal  0.010653  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7285  CDS  NC_010627  38348  39268  +  921  hypothetical protein  YP_001863325  normal  0.170408  normal  0.0138345  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7286  CDS  NC_010627  39347  39739  +  393  hypothetical protein  YP_001863326  normal  0.416625  normal  0.0188893  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7287    NC_010627  40062  42990  +  2929      normal  0.0536925  normal  0.0466877  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7288    NC_010627  43207  44159  +  953      normal  0.101615  normal  0.0519211  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7289  CDS  NC_010627  44174  44440  +  267  hypothetical protein  YP_001863327  normal  0.0163782  normal  0.0631114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7290  CDS  NC_010627  44838  45302  -  465  hypothetical protein  YP_001863328  normal  0.257685  normal  0.0185222  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7291    NC_010627  45458  46655  +  1198      normal  0.641971  normal  0.0593805  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7292  CDS  NC_010627  46639  47001  +  363  hypothetical protein  YP_001863329  normal  0.697625  normal  0.0447962  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7293  CDS  NC_010627  47131  47820  +  690  hypothetical protein  YP_001863330  normal  0.592461  normal  0.05041  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7294  CDS  NC_010627  48182  49462  +  1281  metallophosphoesterase  YP_001863331  normal  0.502471  normal  0.0243654  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7295  CDS  NC_010627  49467  50573  +  1107  hypothetical protein  YP_001863332  normal  1  normal  0.0234328  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7296  CDS  NC_010627  50552  51580  +  1029  hypothetical protein  YP_001863333  normal  0.824058  normal  0.0218594  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7297  CDS  NC_010627  51577  52455  +  879  hypothetical protein  YP_001863334  normal  1  normal  0.0187391  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7298  CDS  NC_010627  52553  54553  +  2001  hypothetical protein  YP_001863335  normal  0.935009  normal  0.0172413  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7299    NC_010627  55698  55911  +  214      normal  0.0217628  normal  0.0129362  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7300    NC_010627  55910  56471  +  562      normal  0.0130484  hitchhiker  0.00884242  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7301  CDS  NC_010627  56695  60438  +  3744  WD-40 repeat-containing protein  YP_001863336  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7302  CDS  NC_010627  60440  61171  +  732  hypothetical protein  YP_001863337  normal  1  hitchhiker  0.00540987  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7303  CDS  NC_010627  61682  62407  -  726  RES domain-containing protein  YP_001863338  normal  1  hitchhiker  0.00177332  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7304  CDS  NC_010627  62367  62753  -  387  hypothetical protein  YP_001863339  normal  1  hitchhiker  0.00271584  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7305  CDS  NC_010627  62993  63787  +  795  integrase, catalytic region  YP_001863340  normal  1  hitchhiker  0.00306385  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7306  CDS  NC_010627  63992  66934  +  2943  transposase Tn3 family protein  YP_001863341  normal  1  hitchhiker  0.0045557  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7307  CDS  NC_010627  67305  76367  +  9063  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  YP_001863342  normal  1  normal  0.0209346  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7308  CDS  NC_010627  76369  76932  +  564  hypothetical protein  YP_001863343  normal  0.385229  decreased coverage  0.000471067  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7309  CDS  NC_010627  76936  77259  +  324  hypothetical protein  YP_001863344  normal  0.132993  hitchhiker  0.00291142  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7310  CDS  NC_010627  77363  78010  +  648  hypothetical protein  YP_001863345  normal  0.0915485  hitchhiker  0.00299315  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7311  CDS  NC_010627  78303  78962  +  660  hypothetical protein  YP_001863346  normal  0.0265413  normal  0.022448  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7312  CDS  NC_010627  79046  80833  +  1788  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  YP_001863347  normal  0.027625  normal  0.0739719  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7313  CDS  NC_010627  80840  81916  +  1077  hypothetical protein  YP_001863348  normal  0.156184  normal  0.0908026  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7314  CDS  NC_010627  81921  82463  +  543  hypothetical protein  YP_001863349  normal  0.332632  normal  0.0516985  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7315  CDS  NC_010627  82478  84004  -  1527  integrase family protein  YP_001863350  normal  0.968074  normal  0.0692077  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7316  CDS  NC_010627  84001  84972  -  972  hypothetical protein  YP_001863351  normal  0.929295  normal  0.0427082  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7317  CDS  NC_010627  85235  86359  -  1125  integrase catalytic region  YP_001863352  normal  0.599541  normal  0.0472875  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7318  CDS  NC_010627  86718  88019  -  1302  FRG domain-containing protein  YP_001863353  normal  0.614163  normal  0.0703577  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7319  CDS  NC_010627  88828  89895  +  1068  ATPase central domain-containing protein  YP_001863354  normal  0.415671  normal  0.136646  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7320  CDS  NC_010627  89885  92134  +  2250  hypothetical protein  YP_001863355  normal  1  normal  0.102954  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7321  CDS  NC_010627  92503  93870  +  1368  AAA ATPase  YP_001863356  normal  1  normal  0.0541267  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7322  CDS  NC_010627  94388  94882  -  495  hypothetical protein  YP_001863357  normal  1  normal  0.0606227  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7323  CDS  NC_010627  94872  95975  -  1104  hypothetical protein  YP_001863358  normal  1  normal  0.0722826  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7324  CDS  NC_010627  96136  97401  +  1266  integrase family protein  YP_001863359  normal  1  normal  0.0511421  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7325  CDS  NC_010627  97526  97795  +  270  hypothetical protein  YP_001863360  normal  1  normal  0.0349001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7326  CDS  NC_010627  98347  98625  -  279  histone family protein DNA-binding protein  YP_001863361  normal  1  normal  0.076405  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7327  CDS  NC_010627  98923  99285  +  363  hypothetical protein  YP_001863362  normal  0.487017  normal  0.0766462  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7328  CDS  NC_010627  99313  101295  -  1983  band 7 protein  YP_001863363  normal  1  normal  0.081025  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7329  CDS  NC_010627  101468  101923  -  456  hypothetical protein  YP_001863364  normal  1  normal  0.0737619  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7330  CDS  NC_010627  101992  103209  -  1218  hypothetical protein  YP_001863365  normal  1  normal  0.0725371  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7331  CDS  NC_010627  103437  103694  -  258  putative transmembrane protein  YP_001863366  normal  1  normal  0.0742415  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7332  CDS  NC_010627  103873  104379  -  507  hypothetical protein  YP_001863367  normal  1  normal  0.22003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7333  CDS  NC_010627  104508  105362  -  855  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001863368  normal  1  normal  0.39139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7334  CDS  NC_010627  105366  107198  -  1833  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  YP_001863369  normal  1  normal  0.285673  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7335  CDS  NC_010627  107198  109243  -  2046  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  YP_001863370  normal  0.989933  normal  0.505585  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7336  CDS  NC_010627  109488  110321  -  834  hypothetical protein  YP_001863371  normal  0.190855  normal  0.603907  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7337  CDS  NC_010627  110524  110877  -  354  hypothetical protein  YP_001863372  normal  0.510094  normal  0.548162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7338  CDS  NC_010627  110874  111173  -  300  adhesin  YP_001863373  normal  0.335427  normal  0.411737  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7339  CDS  NC_010627  111175  112722  -  1548  adhesin HecA  YP_001863374  normal  0.991029  normal  0.53872  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7340  CDS  NC_010627  112919  113263  -  345  hypothetical protein  YP_001863375  normal  1  normal  0.681353  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7341  CDS  NC_010627  113898  114431  -  534  hypothetical protein  YP_001863376  normal  0.570326  normal  0.720933  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7342  CDS  NC_010627  114741  115100  -  360  hypothetical protein  YP_001863377  normal  1  normal  0.706517  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7343  CDS  NC_010627  115283  115633  -  351  hypothetical protein  YP_001863378  normal  1  normal  0.711187  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7344  CDS  NC_010627  115647  115877  -  231  hypothetical protein  YP_001863379  normal  1  normal  0.693694  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7345  CDS  NC_010627  116002  116364  -  363  hypothetical protein  YP_001863380  normal  1  normal  0.869386  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7346  CDS  NC_010627  116361  124361  -  8001  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  YP_001863381  normal  1  normal  0.550949  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>