40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2994 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2994  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  917    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2854  hypothetical protein  98.43 
 
 		 445 aa  902    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  24.18 
 
 		 612 aa  80.1  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  23.77 
 
 		 614 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  23.77 
 
 		 616 aa  76.6  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  25.12 
 
 		 595 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  23.83 
 
 		 639 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  23.83 
 
 		 639 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  24.9 
 
 		 615 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  23.83 
 
 		 643 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0674  hypothetical protein  27.18 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.204696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1505  hypothetical cytosolic protein  27.18 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.293741  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  22.27 
 
 		 642 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  25.11 
 
 		 621 aa  70.5  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  24.68 
 
 		 627 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  24.32 
 
 		 617 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  22.27 
 
 		 634 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  24.08 
 
 		 615 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  23.11 
 
 		 599 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0733  relaxase  22.45 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  23.05 
 
 		 615 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  24.12 
 
 		 680 aa  65.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  24.19 
 
 		 640 aa  63.2  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  20.76 
 
 		 575 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0709  protein of unknown function DUF1528  25.71 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  20.33 
 
 		 623 aa  57  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  21.86 
 
 		 569 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  24.79 
 
 		 593 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  18.62 
 
 		 624 aa  55.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3687  putative helicase  21.55 
 
 		 398 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  24.26 
 
 		 660 aa  53.9  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  22.22 
 
 		 631 aa  53.5  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4118  relaxase  24.29 
 
 		 569 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4049  relaxase  27.27 
 
 		 560 aa  49.7  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  27.85 
 
 		 611 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4265  relaxase  26.45 
 
 		 941 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350547  normal  0.8702 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3357  helicase/Zfx/Zfy transcription activation region domain-containing protein  24.24 
 
 		 551 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0400  relaxase  27.51 
 
 		 570 aa  47.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361957  normal  0.0772849 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3051  protein of unknown function DUF1528  25.24 
 
 		 478 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0065  type IV conjugative transfer system protein TraI  21.3 
 
 		 990 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>