25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1844 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1954  hypothetical protein  94 
 
 		 517 aa  974    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.960644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1844  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  998    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2381  putative virulence effector protein  48.59 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2102  putative virulence effector protein  46.48 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1882  putative virulence effector protein  45 
 
 		 452 aa  382  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1435  putative virulence effector protein  41.5 
 
 		 402 aa  360  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1567  ssrAB activated gene  39.72 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1773  ssrAB activated gene  39.12 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2093  putative virulence effector protein  70.89 
 
 		 465 aa  242  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1748  ssrAB activated gene  58.23 
 
 		 442 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.135386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1711  ssrAB activated gene  58.23 
 
 		 441 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2108  ssrAB activated gene  56.25 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1708  ssrAB activated gene  57.59 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0471  hypothetical protein  55.7 
 
 		 454 aa  196  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4240  hypothetical protein  54.55 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0163273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52100  hypothetical protein  51.23 
 
 		 486 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1846  hypothetical protein  41.4 
 
 		 524 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.378193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2633  hypothetical protein  37.36 
 
 		 451 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.270397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2870  hypothetical protein  38.29 
 
 		 509 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457968  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3155  hypothetical protein  28.37 
 
 		 513 aa  76.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0450583  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0896  hypothetical protein  29.22 
 
 		 421 aa  53.9  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.08458  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1312  hypothetical protein  35 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00429215  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1966  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.38 
 
 		 578 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  30.09 
 
 		 597 aa  47.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  26.44 
 
 		 581 aa  43.5  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>