37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2823 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.138199 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  56.06 
 
 		 421 aa  235  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  56.06 
 
 		 421 aa  235  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  56.06 
 
 		 421 aa  235  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  56.06 
 
 		 421 aa  235  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  56.06 
 
 		 421 aa  235  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  56.06 
 
 		 421 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  56.06 
 
 		 421 aa  234  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  55.56 
 
 		 421 aa  234  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  57.71 
 
 		 421 aa  230  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  36.04 
 
 		 428 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 419 aa  131  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  32.67 
 
 		 427 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  29.21 
 
 		 422 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 438 aa  88.2  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  24.87 
 
 		 417 aa  68.2  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  26.32 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  22.55 
 
 		 425 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  26.8 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  22.65 
 
 		 425 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  22.1 
 
 		 425 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 		 425 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  22.1 
 
 		 425 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 425 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  22.65 
 
 		 425 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  22.65 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 448 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 433 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1681  hypothetical protein  32.39 
 
 		 103 aa  49.7  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3780  hypothetical protein  52.27 
 
 		 65 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  27.38 
 
 		 430 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  27.38 
 
 		 430 aa  48.5  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0318  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 407 aa  42  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  23.68 
 
 		 497 aa  42.4  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 440 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>