44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0562 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0562  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase (glycerophosphodiester phosphodiesterase)  100 
 
 		 89 aa  184  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3992  glycerophosphodiester phosphodiesterase  97.73 
 
 		 371 aa  179  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.220581  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0224  glycerophosphodiester phosphodiesterase  94.32 
 
 		 371 aa  176  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0198  glycerophosphodiester phosphodiesterase  69.66 
 
 		 359 aa  134  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.482615  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2626  glycerophosphodiester phosphodiesterase  63.86 
 
 		 356 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.538824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2522  glycerophosphodiester phosphodiesterase  63.86 
 
 		 356 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2467  glycerophosphodiester phosphodiesterase  63.86 
 
 		 356 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.52374  normal  0.0759304 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2510  glycerophosphodiester phosphodiesterase  63.86 
 
 		 356 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2418  glycerophosphodiester phosphodiesterase  63.86 
 
 		 356 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3959  glycerophosphodiester phosphodiesterase  63.86 
 
 		 361 aa  116  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0259448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3376  glycerophosphodiester phosphodiesterase  53.57 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02124  hypothetical protein  53.57 
 
 		 358 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2391  glycerophosphodiester phosphodiesterase  53.57 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1412  glycerophosphodiester phosphodiesterase  53.57 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.308397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2536  glycerophosphodiester phosphodiesterase  53.57 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02165  periplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  53.57 
 
 		 358 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0198  glycerophosphodiester phosphodiesterase  56.47 
 
 		 360 aa  111  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00238018  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.38 
 
 		 358 aa  110  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.43101  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2621  glycerophosphodiester phosphodiesterase  52.38 
 
 		 358 aa  110  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2379  glycerophosphodiester phosphodiesterase  52.38 
 
 		 358 aa  110  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3177  glycerophosphodiester phosphodiesterase  47.73 
 
 		 359 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1712  glycerophosphodiester phosphodiesterase  46.51 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03310  glycerophosphodiester phosphodiesterase  45.35 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0002  glycerophosphodiester phosphodiesterase  42.35 
 
 		 355 aa  77  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000133502  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002678  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.37 
 
 		 351 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0855489  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0510  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.73 
 
 		 361 aa  63.9  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.554252  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1401  glycerophosphodiester phosphodiesterase  46.77 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000351864  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1072  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.45 
 
 		 419 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.12 
 
 		 419 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.78 
 
 		 360 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3128  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.14 
 
 		 397 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2432  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.18 
 
 		 390 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0322751  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02740  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.99 
 
 		 394 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4210  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.26 
 
 		 383 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01400  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.39 
 
 		 408 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1259  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.47 
 
 		 373 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0649127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1298  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.61 
 
 		 399 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0120956  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0332  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.11 
 
 		 395 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4172  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.88 
 
 		 333 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2092  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.68 
 
 		 368 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0235  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.71 
 
 		 452 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4713  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.27 
 
 		 350 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48120  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30 
 
 		 370 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000260107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.82 
 
 		 379 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>