16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0118 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0118    100 
 
 		 527 bp  1045    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000992019  hitchhiker  9.50651e-69 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3347  RNA-directed DNA polymerase  91.44 
 
 		 1146 bp  563  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0016  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  91.47 
 
 		 1524 bp  551  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.934591  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0025  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  91.47 
 
 		 1524 bp  551  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.352503  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3327  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  91.13 
 
 		 1509 bp  533  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4841  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  91.13 
 
 		 1509 bp  533  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0017  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  91.15 
 
 		 1509 bp  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485362  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0055  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  91.15 
 
 		 1509 bp  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4858  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  91.15 
 
 		 1509 bp  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3158    90.17 
 
 		 1509 bp  502  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3154    88.3 
 
 		 945 bp  99.6  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.32744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4626  RNA-directed DNA polymerase  83.97 
 
 		 1512 bp  93.7  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4498  RNA-directed DNA polymerase  82.09 
 
 		 1515 bp  75.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2025    89.09 
 
 		 1475 bp  61.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2395    89.09 
 
 		 1460 bp  61.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8264  18S rRNA intron 1 protein  90.24 
 
 		 774 bp  50.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0701764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>