44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0119 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0104  hypothetical protein  94.52 
 
 
365 aa  657    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.402195  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0119  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  766    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0158514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2593  hypothetical protein  30.42 
 
 
409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110945  normal  0.12741 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0626  acyltransferase  26.07 
 
 
405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2382  acyltransferase family protein  25.06 
 
 
405 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187003  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1572  acyltransferase 3  27.16 
 
 
409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.653564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4628  hypothetical protein  29.04 
 
 
401 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0357497  hitchhiker  0.00905511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1867  acyltransferase-like protein  27.25 
 
 
397 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0282967  hitchhiker  0.0000000000000352917 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6708  acyltransferase 3  26.45 
 
 
390 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2521  acyltransferase family protein  24.33 
 
 
354 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  25.74 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4669  acyltransferase 3  27.27 
 
 
485 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53122  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  26.45 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0415  hypothetical protein  28.65 
 
 
233 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4209  acyltransferase  23.59 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01696  acyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08520)  24.33 
 
 
547 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0457343  normal  0.0488755 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3594  hypothetical protein  24.66 
 
 
390 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.668123  normal  0.602516 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  22.93 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  23.56 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  26.55 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  23.88 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  24.36 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3723  hypothetical protein  27.47 
 
 
384 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3457  acyltransferase 3  32.45 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0914284  normal  0.537431 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2970  acyltransferase 3  22.63 
 
 
528 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  25.47 
 
 
422 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  24.76 
 
 
387 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  24.58 
 
 
398 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  21.34 
 
 
410 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  21.34 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11061  conserved hypothetical protein  21.8 
 
 
476 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.101379  normal  0.337933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1540  transferase transmembrane protein  23.39 
 
 
404 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0294492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  23.26 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  21.87 
 
 
390 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  22.46 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  22.82 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  24.94 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  24.69 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  22.56 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4099  acyltransferase 3  22.43 
 
 
396 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116738  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  22.56 
 
 
397 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  22.56 
 
 
397 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0747  acyltransferase 3  26.72 
 
 
316 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  25.44 
 
 
381 aa  42.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>